Validation and extraction of molecular-geometry information from small-molecule databases
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Validation and extraction of molecular-geometry information from small-molecule databases
A freely available small-molecule structure database, the Crystallography Open Database (COD), is used for the extraction of molecular-geometry information on small-molecule compounds. The results are used for the generation of new ligand descriptions, which are subsequently used by macromolecular model-building and structure-refinement software. To increase the reliability of the derived data,...
متن کاملextraction and acetylation of purified trypsin from bovin pancreas and study of some its physico-chemical properties
آنزیم تریپسین در شرایط قلیایی ناپایدار می باشد .و فعالیت پروتئولیتیکی تریپسین منجربه خود هضمی آن در جایگاههای خاصی می گردد. بنابر این آنزیمی با ناپایداری بالا محسوب میگردد. در سالهای اخیر موفق شدند که با ایجاد تغیرات شیمیایی با اضافه کردن فلزات خاص ، کلسیم و یا عمل استیلاسیون منجر به افزایش پایداری آنزیم تریپسین گردند. مطالعات در حال حاضر نشان می دهد که تریپسین استیله شده فعالیت آنزیمی خود را ...
15 صفحه اولAdvanced SPARQL querying in small molecule databases
BACKGROUND In recent years, the Resource Description Framework (RDF) and the SPARQL query language have become more widely used in the area of cheminformatics and bioinformatics databases. These technologies allow better interoperability of various data sources and powerful searching facilities. However, we identified several deficiencies that make usage of such RDF databases restrictive or cha...
متن کاملsynthesis of sulfides from alcohols and thiols in solvent-freeconditions and deoxygenation of sulfoxides
کاتالیست یک سنتز جدید برای تیواترها توصیف شده است. واکنش الکل ها با آریل، هتروآریل و آلکیل تیو ل ها درحضور 1،3،5- تری آزو- 2،4،6- تری فسفرین-2،2،4،4،6،6 هگزاکلراید ((tapc به عنوان یک کاتالیست موُثر، بازده های خوب تا عالی از تیواترها را حاصل می کند. علاوه براین، واکنش تحت شرایط بدون فلز و بدون حلال پیش می رود، بنابراین یک مکمل جالب برای روش های شناخته شده سنتز تیواترها ارائه می دهد. یک مکانیسم ا...
15 صفحه اولQuerying Text Databases for Efficient Information Extraction
A wealth of information is hidden within unstructured text. This information is often best exploited in structured or relational form, which is suited for sophisticated query processing, for integration with relational databases, and for data mining. Current information extraction techniques extract relations from a text database by examining every document in the database, or use filters to se...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Acta Crystallographica Section D Structural Biology
سال: 2017
ISSN: 2059-7983
DOI: 10.1107/s2059798317000079